Chiricosta Luigi

Attività di Ricerca

La mia attività di ricercatore verte principalmente su 3 fronti:                       

Bioinformatica:

Ho realizzato pipeline per varianti genomiche e trascrittomica comparativa. Supervisiono la creazione di pipeline per epigenomica e di varianti trascrittomiche. Le pipeline servono per identificare nuove pathway e processi biologici coinvolti nell’insorgenza e nella progressione delle malattie neurodegenerative o per ispezionare i meccanismi di azione di nuovi possibili integratori o farmaci.

Data Science:

Ho pubblicato un modello di intelligenza artificiale per predire la malattia di Alzheimer in modo minimamente inviasivo analizzando il profilo trascrittomico estratto dal sangue dei pazienti. Come candidato PhD, uso la Data Science per scoprire il minimo numero di pattern necessari per caratterizzare le malattie neurodegenerative.

Ingegneria e programmazione:

Mi occupo della realizzazione e manutenzione delle strutture di rete del laboratorio e della gestione dei raw data. Gestisco e organizzo un server fisico, un server virtuale e i sequenziatori NextSeqDx550 e MiSeqDx. Creo interfacce web per la data analysis e mantengo aggiornati i backup sul NAS aziendale.

Aree di Interesse

• Bioinformatica
• Intelligenza artificiale
• Programmazione
• Modellistica, matematica e statistica
• Ingegneria

Research Activities

My research activity is mainly focused on 3 fronts:

Bioinformatics:

        I have built pipelines for genomic variants and comparative transcriptomics. I supervise the creation of pipelines for epigenomics and transcriptomic variants. The pipelines are used to identify novel pathways and biological processes involved in the onset and progression of neurodegenerative diseases or to inspect the mechanisms of action of possible new supplements or drugs.

Data Science:

       I have published an artificial intelligence model to predict Alzheimer's disease in a minimally invasive way by analyzing the transcriptomic profile extracted from patients' blood. As a PhD candidate, I use Data Science to discover the minimum number of patterns needed to characterize neurodegenerative diseases.

Engineering and Programming:

       I am responsible for the implementation and maintenance of the lab's network facilities and raw data management. I manage and organize a physical server, a virtual server, and the NextSeqDx550 and MiSeqDx sequencers. I create web interfaces for data analysis and maintain up-to-date backups on the corporate NAS. 

Areas of Interest 

- Bioinformatics

- Artificial intelligence

- Programming 

- Modeling, mathematics and statistics 

- Engineering